O diagnóstico Ambiental foi realizado considerando os aspectos socioeconomicos e ambientais da região. Vários mapas temáticos foram confeccionados visando a classificação das bacias hideográficas em função dos diferentes usos da terra  e características dos recursos naturais (vegetação, solo, clima e água).

Devida a expansão agroindustrial na região houve um crescente conflito entre os usos múltiplos das águas na região. Em especial, ocorre o conflito pela demanda por água de alta qualidade, para o desenvolvimento das atividades econômicas e como receptor dos dejetos dessas mesmas atividades. A demanda para irrigação merece particular atenção, devido à necessidade de emprego de águas de alta qualidade, a fim de garantir uma produção que atenda às demandas dos exigentes mercados compradores de frutas de manga e uva in natura.

O projeto Ecoágua subsidiou o Projeto de Produção Integrada de Manga e Uva com as informações obtidas no diagnóstico ambiental das principais Bacias Hidrográficas do Rio São Francisco. As bacias se caracterizam por uma concentração de fontes de poluição, relacionadas principalmente por descargas de poluentes orgânicos provenientes de um importante parque de indústrias alimentícias neste mesmo município. Existem na região estudada 1196 unidades industriais organizadas , as quais ocupavam 5467 pessoas, sendo que, 33% destas indústrias localizavam-se em Juazeiro (BA). Cerca de 10% dos estabelecimentos referidos são de produtos alimentícios.

Para a caracterização da região foram utilizados mapas digitalizados onde foram delimitadas e caracterizadas as Bacias Hidrográficas e a malha hídrica. Sobre essa base de informação, foram sobrepostas imagens de satélite para complementar a caracterização da região (identificação de lagoas, açudes, lagos, rios, poços), distribuição das unidades de produção irrigadas e dos sistemas dependentes de chuva.

Distâncias Interfluviais são as distâncias entre cada rio distribuído na rede hidrográfica em um raio de 360 graus. Essas distâncias identificam setores diferenciados pela distribuição da freqüência de rios por unidade de área. Distâncias interfluviais altas significam menor densidade de rios por quilômetro quadrado, o que significa uma presença de rede de drenagem fraca.

O índice de vegetação classificou os diferentes tipos de vegetação na região servindo como indicador de degradação ambiental e de concentração de biomassa em uma área.

As atividades com potencial de geração de poluição foram caracterizadas e classificadas de acordo com o grau de emissão dos prováveis poluentes em três classes: reduzida, média e elevada.

Foi realizado um inventário da qualidade dos diferentes corpos de águas (rios, lagos, açudes, poços, canais de irrigação e de drenagem) em seus parâmetros físicos químicos e biológicos. 

Caracterização dos recursos naturais	Para a caracterização da região foram utilizados mapas digitalizados.
Distâncias Interfluviais: indicador de áreas susceptíveis a impactos nos recursos hídricos.	Indicador da distribuição da rede de drenagem e, conseqüentemente de áreas mais susceptíveis a impactos nos recursos hídricos.
Índice de Vegetação: indicador de degradação ambiental e de biomassa vegetal.	O índice de vegetação: um indicador de degradação ambiental e de biomassa na região.
Atividades potenciais de poluição	Identificação e classificação das atividades com potencial de poluição.
Qualidade da água	A análise da qualidade das águas foi realizada em diferentes corpos de água.

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